本场比赛当值裁判组的判罚却引起了比较大的争议。据了解，玉昆俱乐部赛后第一时间责成专人收集材料，并准备就本场比赛期间三次比较明显的争议判罚向中足联提出书面申诉。

云南玉昆申诉的第一方面内容：

比赛第63分钟，申花队发动前场进攻，其外援马纳法疑似在越位位置上接到队友安德烈斯头球助攻后完成两连击，从而为申花队获得导致扳平比分入球的那次角球机会；

云南玉昆申诉的第二方面内容：

比赛第77分钟，申花球员李可抢球时，其右脚明显蹬在了客队外援内内左腿迎面骨上，但裁判员未对此动作进行判罚；

云南玉昆申诉的第三方面内容：

比赛第78分钟左右，当值主裁判示意客队被犯规，应主罚后场任意球。当时皮球离事发地点有相当的距离，玉昆队弋腾将球踢向后场发球区域，结果被当值主裁判出示个人第二张黄牌，从而被罚出场。

云南玉昆方面认为这几次判罚都存在比较明显的错、漏判。虽然比赛结果无法更改，但作为一家升班马俱乐部，云南玉昆方面还是希望能够通过正当渠道按程序维护自身权益，恳请赛事主管部门维护竞赛公平公正。